Cypher 007 imerge os jogadores em uma experiência emocionante de ação stealth, onde eles assumem o papel do icônico espião britânico, Agente 007. Nesta narrativa envolvente, seu inimigo, Blofeld, elaborou um plano sinistro que envolve a captura e o aprisionamento de Bond em uma instituição psiquiátrica. O vilão pretende usar uma técnica de lavagem cerebral chamada Cypher, transformando Bond em um agente duplo ideal. Os jogadores devem navegar por uma série de níveis complexos, coletando informações e descobrindo verdades ocultas enquanto utilizam uma variedade de habilidades de espionagem. À medida que avançam, os desafios se tornam mais formidáveis, exigindo estratégia e precisão para frustrar as maquinações de Blofeld e escapar das garras de seu plano nefasto.