Kaori After Story Visual Novel entfaltet sich in einer typischen Schulumgebung, in der das alltägliche Leben des Protagonisten eine außergewöhnliche Wendung nimmt, nachdem er einer mysteriösen alten Frau begegnet. Sie drängt ihn, ein Heiligtum zu besuchen und sich einen Wunsch zu erfüllen, der überraschenderweise wahr wird, als er Arilynn, eine atemberaubende Prinzessin aus einem parallelen Reich, heraufbeschwört. Während der Teenager mit den Folgen dieses magischen Ereignisses kämpft, sieht er sich nicht nur akademischem Druck ausgesetzt, sondern auch der Herausforderung, das Geheimnis hinter seinem Wunsch und seinen Konsequenzen zu enthüllen. Die Spieler navigieren durch eine fesselnde Erzählung, treffen Entscheidungen, die den Weg für gewünschte Ergebnisse ebnen, während sie die miteinander verwobenen Schicksale beider Charaktere enthüllen.