Sigma Theory taucht die Spieler in ein fesselndes RPG-Strategie-Spiel ein, das vor dem Hintergrund eines futuristischen Kalten Krieges spielt, der sich auf globaler Ebene entfaltet. Während sich die Erzählung entwickelt, steht die Menschheit am Rande einer revolutionären Entdeckung, die das Potenzial hat, die Technologie und das menschliche Dasein grundlegend zu verändern. Verschiedene mächtige Fraktionen versuchen, diese Fortschritte zu nutzen, um Dominanz zu erlangen, was das globale Finanzsystem destabilisiert und sogar die Aussicht auf Unsterblichkeit verfolgt. Dieser Kampf um die Vorherrschaft führt jedoch zu einem intensiven globalen Konflikt, der weitreichende Zerstörungen und den Verlust von Millionen zur Folge hat. Die Spieler übernehmen die Rolle eines Wissenschaftlers, der an dieser entscheidenden Entdeckung beteiligt ist, und navigieren durch ein komplexes Geflecht aus Intrigen und Wettbewerb, während sie sich bemühen, sicherzustellen, dass die Verbündeten ihrer Nation den technologischen Vorteil zuerst erlangen.