ट्रेन टॉवर डिफेंस पारंपरिक टॉवर डिफेंस शैली में एक नया मोड़ पेश करता है, जिसमें खिलाड़ियों को थॉमस नाम के एक मशीनिस्ट की भूमिका में रखा गया है, जो अपने सोने से भरे ट्रॉलियों को सुरक्षित करने के मिशन पर है। जैसे-जैसे वह विभिन्न स्थानों के माध्यम से यात्रा करता है, थॉमस लगातार आक्रामक लहरों का सामना करता है, जिनमें उरक, गोब्लिन और शमन शामिल हैं, जो सभी उसकी प्रगति को रुकवाने के इरादे से आते हैं। खिलाड़ियों को इन खतरनाक दुश्मनों से ट्रेन की रक्षा के लिए रक्षा टॉवरों का निर्माण करने के लिए रणनीतिक रूप से संसाधनों का प्रबंधन करना चाहिए। एक ऐसी ट्रेन के साथ जो विकसित हो सकती है और विशेष क्षमताओं की विविधता का उपयोग कर सकती है, साथ ही दस प्रकार के टॉवर और पांच विभिन्न दुश्मन प्रकारों के साथ, खेल कस्टमाइज़ेशन और रणनीतिक योजना के लिए समृद्ध संभावनाएं प्रदान करता है, जिसमें दस विविध मानचित्र शामिल हैं।