Sigma Theory immerge i giocatori in un avvincente gioco di strategia RPG ambientato nell'epoca di una guerra fredda futuristica che si svolge su scala globale. Con il progredire della narrazione, l'umanità si trova sull'orlo di una scoperta rivoluzionaria che minaccia di rivoluzionare la tecnologia e l'esistenza umana. Diverse potenti fazioni mirano a sfruttare questi avanzamenti per affermare la propria dominanza, destabilizzando il sistema finanziario globale e perseguendo persino la prospettiva dell'immortalità. Tuttavia, questa ricerca di supremazia conduce a un intenso conflitto globale, che provoca ampie devastazioni e la perdita di milioni di vite. I giocatori assumono il ruolo di uno scienziato coinvolto in questa scoperta cruciale, navigando in un complicato panorama di intrighi e competizione mentre si sforzano di assicurarsi che gli alleati della propria nazione rivendichino per primi il vantaggio tecnologico.